Фамилия Мамаркова — женская форма фамилии Мамарков, а та, в свою очередь, образована от прозвища или личного имени Мамар. В русской ономастике это редкий случай, где корень не связан с привычными «мама» или «мамонт», а уходит в тюркские языки.

Скорее всего, в основе лежит тюркское слово «мамар» — так в некоторых диалектах называли почтенного, уважаемого старца, наставника, а иногда — знахаря или лекаря. В среде татар, башкир и других тюркских народов такое прозвище давали человеку мудрому, сведущему в травах или обрядах. Русские фамилии с корнем «мамар» встречаются преимущественно в Поволжье и на Урале, в зонах активного русско-тюркского смешения. Суффикс -ов/-ев указывает на типичную русскую патронимическую модель: «чей?» — Мамарков, то есть сын или потомок Мамара.

Есть и менее вероятная версия: от греческого имени Мамас (в русской традиции — Мамант), которое через уменьшительную форму Мамар могло дать фамилию. Но греческое влияние в простонародной среде было слабее тюркского, поэтому первая гипотеза выглядит убедительнее.

Фамилия Мамаркова не относится к числу распространённых. В дореволюционных переписях она фиксировалась в основном в крестьянской среде Симбирской и Казанской губерний. Носительницы этой фамилии, скорее всего, потомки людей, получивших прозвище по занятию или характеру — знахарей, уважаемых стариков, а не по имени отца.