Фамилия Маможанов — одна из тех, что сразу привлекает внимание необычным звучанием. Скорее всего, её основа восходит к тюркскому миру, где слово «мама» или «мамо» могло означать не «мать», а «бабушку» или почтительное обращение к старшей женщине. Второй компонент — «жан» (душа, человек) — широко распространён в казахских, узбекских, татарских и башкирских именах. Таким образом, Маможан — это составное личное имя, которое можно перевести как «душа бабушки» или «родной, как бабушка». Имя давали, вероятно, в честь уважаемой пожилой родственницы, желая ребёнку её мудрости и долголетия.

Русский суффикс -ов добавляет к этой основе значение принадлежности: Маможанов — «сын (или потомок) Маможана». Такая модель типична для фамилий, которые возникали в XIX–XX веках при оседании кочевых народов или при переселении в русскоязычную среду. Фамилия не могла появиться раньше, чем имя Маможан стало достаточно распространённым, а это происходит не ранее второй половины XIX века.

Встречается фамилия преимущественно на юге Урала, в Оренбуржье, Башкортостане и в северных областях Казахстана — именно там, где веками соседствовали тюркские и славянские общины. В дореволюционных метрических книгах её почти нет, так как многие носители не имели фамилий до советского паспортного учёта.

Интересно, что в фамилии нет типичного для тюркских языков суффикса -улы/-кызы, который указывал бы на отчество. Вместо этого использован русский патроним. Это говорит о том, что предок носителя фамилии, скорее всего, жил в смешанной среде, где документы оформляли по русским образцам. Вероятно, он был крестьянином или казаком — сословная принадлежность для таких фамилий обычно низкая или средняя, без дворянских корней.

Спорных версий немного. Иногда пытаются связать «Мамо» с арабским «мамун» (надёжный, безопасный), но это фонетически натянуто: в фамилии ясно слышен именно тюркский корень, а не арабский.