Фамилия Манасиина звучит необычно и сразу привлекает внимание своим окончанием. На первый взгляд, её можно принять за женскую форму, но по правилам русской ономастики это именно исходная, историческая форма фамилии, принадлежащая женщине. В русской традиции фамилии на -ин, -ов, -ский склоняются по падежам, и форма «Манасиина» — это именительный падеж женского варианта. Мужской вариант, соответственно, Манасиин. Такое окончание характерно для притяжательных фамилий, образованных от личного имени или прозвища с помощью суффикса -ин.

Основа фамилии — «Манасий». Это имя имеет библейские корни и восходит к древнееврейскому «Менашше», что означает «заставляющий забыть» или «дающий забвение». В православных святцах имя Манасия (или Манассия) встречается как имя одного из ветхозаветных царей и нескольких святых. В русской среде имя Манасий было редким, но встречалось, чаще в среде духовенства или в старообрядческих семьях. Фамилия Манасиин (и её женская форма Манасиина) образована по простой модели: от имени Манасий отсекли окончание -ий и добавили притяжательный суффикс -ин, указывающий на принадлежность потомку человека с этим именем. То есть Манасиин — буквально «чей?» — сын Манасия.

Географически фамилия Манасиина, судя по архивным данным и современным базам, встречается крайне редко. Основные очаги её бытования — регионы Русского Севера, Поволжья, а также некоторые области Сибири, куда переселялись старообрядцы. Это неудивительно: имя Манасий, хоть и каноническое, в народном обиходе почти вышло из употребления, сохранившись именно в среде, где чтили старые традиции имянаречения. Таким образом, предки Манасииных, скорее всего, были либо крестьянами из старообрядческих общин, либо людьми духовного звания, где библейские имена давали чаще.

Стоит отметить, что ударение в фамилии, скорее всего, падает на второй слог — Мана́сиина, хотя в разговорной речи возможны варианты. Фамилия эта — живой памятник редкому церковному имени, которое почти исчезло из обихода, но сохранилось в нескольких семейных ветвях.