Фамилия Мангуби — одна из тех, что хранит прямую географическую привязку. Её основа — топоним Мангуп. Так назывался средневековый город-крепость в восемнадцати километрах южнее Бахчисарая, столица греко-готского княжества Феодоро, которое пало под натиском турок в 1471 году. Сегодня Мангуп — городище и один из исторических центров, где издавна селились караимы, немногочисленная тюркская народность.

Происхождение самого названия «Мангуп» точно не установлено, но есть убедительная версия. Исследователи Перналь и Эссар возводят его к арабскому слову mankub или mangub — «место, изобилующее пещерами». Это хорошо согласуется с ландшафтом: Мангуп — плато с вырубленными в скалах пещерными комплексами, которые веками служили оборонительными и хозяйственными помещениями.

Фамилия образована по модели, типичной для тюркских языков: к топониму добавили суффикс принадлежности -и. В тюркском словообразовании такой суффикс (как в фамилиях Крыми, Узбеки) указывает на происхождение или проживание. Таким образом, Мангуби дословно значит «из Мангупа», «мангупский». Носитель фамилии — человек, чьи предки были выходцами из этого городища или принадлежали к караимской общине, исторически связанной с Мангупом.

Фамилия редкая, но не единичная. Самый известный носитель — американская художница Марина Анатольевна Мангуби, происходящая из караимской семьи. Её биография подтверждает связь фамилии с караимским этническим корнем. Других широко известных однофамильцев нет, что делает фамилию узколокальной и ценной для генеалогического поиска.