Фамилия Маннонкулов — редкий пример фамилии, образованной от арабского по происхождению имени с тюркским суффиксом принадлежности. Её основа — сложное имя Маннонкул, где первая часть восходит к арабскому «Маннан» (один из эпитетов Аллаха — «Дарующий блага, Милостивый»), а вторая — тюркское «кул» (раб, слуга). В сумме это даёт значение «раб Милостивого», то есть человека, посвятившего себя Богу. Такие теофорные имена (содержащие отсылку к Всевышнему) были особенно распространены в Центральной Азии, в среде оседлого и полукочевого населения, исповедовавшего ислам.

Фамилия построена по русской патронимической модели: к основе Маннонкул добавили суффикс -ов, что типично для русификации фамилий в XIX–XX веках, когда в документах (например, при переписях или выдаче паспортов) местным именам придавали привычную для имперской бюрократии форму. Изначально Маннонкулов означало «сын Маннонкула», но со временем закрепилось как наследственная фамилия.

Географически фамилия почти наверняка происходит из Узбекистана или Таджикистана — регионов, где имя Маннонкул встречается чаще всего. В русскоязычной среде она остаётся крайне редкой: носители, как правило, потомки мигрантов из Средней Азии, чьи предки получили фамилию при советской паспортизации 1920–1930-х годов. В те годы многие узбекские и таджикские семьи впервые получили постоянные фамилии, и чиновники часто механически добавляли окончание -ов к отцовскому имени.

Любопытная деталь: в самом имени Маннонкул ударение в разговорной речи может падать как на первый слог (Мáннонкул), так и на последний (Маннонкýл) — это зависит от местного диалекта. В фамилии же ударение обычно фиксированное, на предпоследний слог: Маннонкýлов. Если сравнивать с однокоренными фамилиями (например, Маннанов, Кулов), Маннонкулов выделяется двойной основой, что делает её более редкой и конкретной в значении — она не просто отсылает к «слуге», а прямо указывает на религиозный подтекст имени предка.