Фамилия Маппыров — редкий случай, когда суффикс -ов присоединён к основе, которая не сразу поддаётся расшифровке. В ней нет привычного русского корня, связанного с ремеслом или внешностью, и это сразу выдаёт её вероятное нерусское происхождение. Скорее всего, перед нами фамилия тюркского корня, адаптированная русским окончанием.

Основа «Маппыр» может восходить к тюркскому личному имени или прозвищу. В тюркских языках корень «мап» или «маппа» встречается в значениях, связанных с «мягкостью», «нежностью» или «слабостью» (сравните с казахским «маппа» — «мягкий», «вялый»). Однако более вероятна версия, что это искажённая форма арабского имени, которое через исламскую культуру попало к тюркским народам. Например, имя «Маппар» могло быть вариантом имени «Мабрур» (от араб. «мабрур» — «благословенный», «праведный»), где произошла замена «б» на «п» — явление, частое в тюркской фонетике. В таком случае фамилия Маппыров — это «сын Маппара», то есть потомок человека, которого называли благословенным.

Суффикс -ов в конце указывает, что фамилия оформилась в русской среде, скорее всего, в XIX — начале XX века, когда тюркские народы (татары, башкиры, казахи) массово получали фамилии по русскому образцу. Географически такая фамилия наиболее вероятна в Татарстане, Башкортостане, Оренбуржье или среди сибирских татар. Второй вариант: основа могла быть прозвищем — «маппыр» в некоторых тюркских диалектах могло означать «мямля», «неповоротливый человек», но эта версия менее надёжна из-за отсутствия широкой фиксации такого слова в словарях.

Однокоренных фамилий в русском ономастиконе почти нет. Встречаются единичные варианты «Маппаров» (с одним «п») или «Мапперов», но они ещё более редки. Это делает фамилию Маппыров уникальной в своём роде — она не массовая, а локальная, и её носители, скорее всего, происходят из одного небольшого рода или селения.