Фамилия Маратенков — одна из тех, где сразу бросается в глаза суффикс -енк-. В русских фамилиях он чаще встречается на юге и западе, в украинском и белорусском влиянии. Однако окончание -ов подсказывает, что перед нами не чисто малороссийская форма, а адаптированная под русскую модель: сначала было прозвище или имя, к нему добавили -енк(о), а затем, при переселении или в документах, нарастили -ов. Получился гибрид, характерный для пограничных регионов или для фамилий, которые оформились уже в XIX веке, когда носители переходили из крестьян в мещане.

Основа — Маратенок или Маратенко. Корень «Марат» здесь, скорее всего, не связан с французским революционером: фамилии на -енко обычно народные, бытовые. Вероятнее, что в основе лежит прозвище Марат — от глагола «марать» (пачкать, делать нечисто). В старых говорах «марата» или «маратый» — человек, который неопрятен, пачкает одежду, или же тот, кто занимается грязной работой, скажем, печник, трубочист, кожевник. В этом случае Маратенок — сын или потомок такого человека (уменьшительно-пренебрежительная форма).

Менее вероятна, но возможна версия от имени Марат как варианта крестильного имени Марк или Мартин в просторечии (где «р» могло перейти в «а»). Однако документальных подтверждений такой трансформации для этой фамилии нет.

Географически фамилия редкая, встречается точечно в центральных областях России и на юге — в Курской, Белгородской, Воронежской областях. Там как раз и бытовала модель на -енков (переход украинского -енко в русское -енков).

По сословию — почти наверняка крестьянская или однодворческая. Дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано. Предки Маратенкова могли быть земледельцами, ремесленниками или людьми, занятыми в «грязных» промыслах — кожевенном, гончарном, кузнечном, где сажа и копоть были обычным делом. Прозвище Марат, давшее фамилию, могло закрепиться за человеком, который работал с глиной или дёгтем.