Фамилия Маршубина — женская форма, а мужская — Маршубин. Она образована по самой распространённой в русском языке модели: от основы, оканчивающейся на согласный, с помощью суффикса -ин. Это указывает на принадлежность: «чей?» — Маршубин, то есть сын или потомок человека по прозвищу Маршуба.

Корень фамилии — Марш-. Здесь возможны два основных объяснения, и оба лежат в сфере прозвищ, а не крестильных имён. Первое: основа связана со словом «марш» в значении «походка, хождение строем» или с глаголом «маршировать». В таком случае Маршубой могли прозвать человека с особой, чёткой или военной походкой, либо того, кто любил ходить «в ногу», подчиняясь ритму. Второе, более вероятное с точки зрения народной ономастики: это вариант тюркского имени или прозвища Марш (или Марша), которое в русском языке получило уменьшительно-ласкательный суффикс -уба. Такие суффиксы (-уша, -уба, -уня) характерны для диалектной, разговорной речи: например, Ванюша, Петруня. То есть Маршуба — это ласковое или фамильярное именование человека по имени Марш (или по основе Мар-).

Суффикс -уба — редкий, нечастый в русских фамилиях. Он встречается в единичных случаях (сравните фамилии Хоробрый — Хоробруба, или прозвища вроде Гуляба). Это делает фамилию Маршубина отличительной: она не входит в массовые типы на -ов/-ев, а стоит в ряду более редких «индивидуальных» образований.

Географически фамилия Маршубин встречается не повсеместно. Основные очаги — южные и центральные регионы России, а также Поволжье, где сильны тюркские влияния. Это косвенно подтверждает версию о тюркской основе: в татарском и башкирском языках есть имя Марш (возможно, сокращение от Маршал или от арабского Марьям, но в мужском варианте). В русской среде такое имя переосмыслили, придали ему «свой» суффикс, и получилось прозвище Маршуба.

Социально носители фамилии, скорее всего, происходили из крестьян или посадских людей. Фамилии на -ин у непривилегированных сословий фиксировались в документах с XVI–XVII веков, но массово закрепились после отмены крепостного права. Маршубины — не дворянский род, а фамилия, возникшая в народной среде, где прозвище закреплялось за целой семьёй.

Таким образом, фамилия Маршубина означает «принадлежащая Маршубе» — человеку, которого за походку или по имени-прозвищу так называли. Это редкий случай, когда в основе — не имя святого и не ремесло, а бытовая, диалектная меткость.