Фамилия Марсканов — редкая и морфологически прозрачная, но с неочевидной основой. Она образована по стандартной русской модели с суффиксом -ов, который указывает на принадлежность: Марскан → Марсканов, то есть «сын Марскана». Суффикс -ан в основе — типичный для тюркских и кавказских языков, он часто встречается в именах и прозвищах, например, Акжан, Алжан, Искан. Скорее всего, в основе лежит личное имя или прозвище Марскан, которое, в свою очередь, сложилось из двух частей: «марс» и «кан».

Первая часть — «марс» — может восходить к арабскому или тюркскому корню со значением «мужественный», «отважный», или к имени Марс (редкое у русских, но встречающееся у народов Кавказа как вариант Мурсал). Вторая часть — «кан» — в тюркских языках означает «кровь» или «род», а в именах часто выступает как усилитель: «хан», «владыка», «господин». Таким образом, Марскан — сложное имя, которое можно перевести как «мужественный хан» или «отважный род». Версия с арабским корнем «марс» (связанным с воинской доблестью) выглядит правдоподобнее, чем предположение о связи с планетой Марс: такие астрономические заимствования в личных именах кочевников нехарактерны.

Географически фамилия Марсканов тяготеет к Северному Кавказу, в частности к Дагестану и Чечне, где распространены имена с компонентом «кан». Встречается она и у татар, но реже. Социально предки Марскановых могли быть из среды горцев или тюркских народов, где подобные имена давали в знак уважения к силе и знатности. Сословная принадлежность не фиксируется: носители фамилии могли быть как узденями (свободными общинниками), так и выходцами из духовенства или военной знати. Написание фамилии устойчивое, без вариантов, что указывает на её позднее оформление в русской документации — скорее всего, в XIX–XX веках, когда фиксировали фамилии по отчеству.

Сравнение с однокоренными фамилиями — Марсков, Марсаков, Марсканский — показывает, что основа Марскан уникальна: она не имеет параллелей в славянских языках, что подтверждает её иноязычное происхождение. Фамилия Марсканов — пример того, как тюркское или кавказское имя, пройдя через русскую фамильную модель, сохранило свою внутреннюю форму, но потеряло прозрачность для носителя русского языка.