Фамилия Маручкова образована от мужского имени или прозвища Маручко, а оно, в свою очередь, — уменьшительная форма от крестильного имени Маруда. В святцах имени Маруда нет, но в народном обиходе так называли людей с трудным, «муторным» характером: слово «маруда» в русских говорах означало медлительного, нудного или капризного человека. Имя Маруда было нередким в XVI–XVII веках, особенно в северных и центральных областях России, и давалось как мирское, нецерковное имя. От него пошли фамилии Марудин, Марудов, а через уменьшительную форму Маручко — Маручковы.

С точки зрения словообразования, фамилия Маручкова — женская форма от Маручков, которая строится по типичной восточнославянской модели: основа Маручк- + суффикс -ов. Суффикс «-ко» в основе (Маручко) — характерный для украинских, белорусских и южнорусских говоров уменьшительный формант, который часто переходил в фамилии без изменений. То есть предок носителя фамилии, скорее всего, происходил с территории современной Украины или юга России, где такие формы особенно распространены. В документах XVII века встречаются казаки и мещане с прозвищем Маручко, что подтверждает бытование этой основы в среде вольного населения.

Есть и другая, менее вероятная версия: связь с литовским или балтским корнем «mar-» (море, болото), но для фамилии Маручкова она не находит убедительных подтверждений в русских говорах. Учитывая частоту суффикса «-чк-» в восточнославянских именах, прозвищная версия от «маруды» остаётся основной.

Географически фамилия Маручкова сегодня встречается разрозненно, но чаще всего в южных областях России (Краснодарский край, Ростовская область) и на Украине. В дореволюционных переписях носители фамилии фиксировались среди крестьян и мещан, что типично для фамилий, образованных от мирских имён: они не указывали на дворянское происхождение, а скорее на рядовое сельское или посадское сословие.