Фамилия Машкинцева — женская форма фамилии Машкинцев, и её разбор стоит начать не с корня, а с суффиксальной цепочки, которая выдаёт редкую модель образования. Суффикс -цев (в мужском варианте -ов/-ев превращается в -цев) указывает на принадлежность: в русской ономастике фамилии на -цев обычно означали «сын такого-то» или «потомок», где основа — прозвище или имя отца. В данном случае основа — Машкин, то есть уменьшительное от Машка. Но Машка — это не женское имя в прямом смысле, а просторечная форма мужского имени Матвей (через Матюшка — Машка) или, реже, имени Макар. Так что фамилия Машкинцев буквально значит «внук (или потомок) Машки», где Машка — ласкательное прозвище мужчины.

Географически фамилия Машкинцева встречается в основном в южнорусских и центральных областях: Курская, Белгородская, Воронежская, Ростовская. Это не случайно — суффикс -цев в фамилиях особенно характерен для южнорусских говоров, где вместо общераспространённого -ов/-ев нередко использовали именно -цев, подчёркивая патронимическую связь через поколение. Например, Машкинцев — это «внук Машкина», а не просто «сын Машки». Такая двойная суффиксация встречается реже, чем простые формы на -ов, и делает фамилию более локальной и узнаваемой.

Есть и вторая, менее вероятная версия: основа могла пойти не от имени, а от прозвища Машка. В русских говорах «машка» — это иногда лошадь с мастью в яблоках (от слова «масть»), или же мимолётное прозвище для человека, который пачкается, мажется (от глагола «мазать»). Но в случае с фамилией Машкинцев первая версия — от имени — выглядит убедительнее, так как прозвищные фамилии с суффиксом -цев встречаются редко, а уменьшительные формы имён в основе — типичное явление.

В документах XVIII–XIX веков фамилия Машкинцев фиксируется среди однодворцев и государственных крестьян южных уездов. Однодворцы — это потомки служилых людей, которые несли сторожевую службу на границе и со временем перешли в разряд крестьян, но сохранили личную свободу. Так что предки носительницы фамилии Машкинцева, скорее всего, были не крепостными, а вольными землепашцами или мелкими служилыми людьми, что добавляет фамилии исторический оттенок «южного пограничья».