Фамилия Медовкин — один из характерных примеров «вкусных» русских фамилий, образованных от названий продуктов или сладостей. В основе лежит слово «мед» в значении «сладкое вещество, вырабатываемое пчелами», но не прямо, а через производное прилагательное или прозвище. Суффикс -к- в середине (Медов-к-ин) указывает на то, что исходным было не просто слово «мед», а скорее «медовка» или «медовый». «Медовкой» в народе называли медовую наливку, сбитень или пряник на меду. Соответственно, прозвище Медовка могли дать либо любителю сладкого, либо, что вероятнее, человеку, который торговал медовыми напитками и лакомствами. В этом случае фамилия Медовкин — патроним от прозвища Медовка, то есть «сын Медовки».

Модель образования типична для русских фамилий XVI–XVII веков: суффикс -ин присоединялся к основам на -а/-я. Медовкин значит «чей?» — из рода Медовки. Фамилия недворянская, скорее всего, крестьянская или мещанская, так как образована от бытового прозвища, а не от церковного имени или географического названия.

В ономастических словарях фамилия Медовкин встречается реже, чем, скажем, Медов или Медведев, но у неё есть очевидные «родственники»: Медовников (от «медовник» — торговец медом или пчеловод), Медовый, Медовщиков. Географически фамилия тяготеет к южнорусским и центральным регионам — Тамбовской, Воронежской, Рязанской областям, где исторически было развито пчеловодство и бортничество. Встречается и на Украине, в форме Медовкін.

Есть и более спорная версия: связь с церковным именем Мефодий. В народе это имя могли переделать в Медодий, а затем в Медовка — через ассимиляцию и «народную этимологию», когда непонятное имя заменяли понятным словом. Однако эта гипотеза слабая: фамилий от Мефодия известно немного (Мефодьев, Мефодин), и переход в «медовый» ряд маловероятен без явного прозвища. Правдоподобнее всё же прозвище от медового продукта.

Таким образом, предок носителя фамилии Медовкин — не обязательно пчеловод, а скорее человек, связанный с приготовлением или продажей медовых угощений: пряничник, сбитенщик или содержатель медовухи.