Фамилия Мегдиник — редкая и не сразу поддающаяся разбору, но её строение указывает на определённую географию и историю. Если отбросить суффикс -ик, который в русских фамилиях часто служит уменьшительным или указывает на лицо по действию (как в «школьник»), то основа — Мегдин-. Здесь явно видна тюркская или арабо-тюркская основа «мегди» — вариант имени Махди (араб. «ведомый», «направляемый»). В исламской традиции Махди — это пророк или праведник, а в тюркских языках имя могло звучать как Мегди, Мехди или Меджид.

Суффикс -ик в данном случае, скорее всего, не русский, а тюркский или армянский патронимический формант, означающий «сын» или «принадлежащий». В армянской ономастике суффикс -ик образует фамилии от имён (например, Арутюнян, но бывают и формы на -ик, особенно в диалектах). В тюркских языках -ик может быть уменьшительным или указывать на профессию. Таким образом, Мегдиник — «сын Мегди» или «маленький Мегди».

Географически фамилия, вероятнее всего, имеет корни на Северном Кавказе или в Закавказье — в среде горских евреев, татов или азербайджанцев, где имя Мегди (Мехди) распространено, а суффикс -ик встречается в фамилиях. Не исключено, что носители фамилии — потомки выходцев из Дербента или Кубы, где смешивались тюркские, еврейские и армянские традиции имяобразования.

В русском контексте фамилия могла возникнуть при фиксации в метриках: священник или писарь записал прозвище или отчество в форме Мегдиник, придав ему окончание, похожее на русские фамилии на -ик (как Кузнечик, Пирожник). Однако это не русская модель — суффикс -ик в русских фамилиях встречается редко и чаще в прозвищах, чем в патронимах.

Версия о еврейском происхождении (от имени Мегди, Мехди) поддерживается тем, что среди горских евреев фамилии на -ик встречаются (например, Абрамик, Исаковик), и они часто сохраняют арабские или персидские имена. Таким образом, предок носителя фамилии мог быть человеком по имени Мегди, а его дети или внуки получили фамилию по отцу.

Спорных версий здесь немного: попытка вывести Мегдиник из славянского «мегд» (несуществующее слово) или из греческого «мегас» (большой) — натяжка, так как фонетика и суффикс не стыкуются. Правдоподобнее всего — тюрко-кавказский след с арабским именем в основе.