Основой фамилии Мельяченко послужило церковное имя Емельян (Емилиан). Фамилия Мельяченко образована от имени Мельяк, уменьшительной формы имени Мельян. Оно, в свою очередь, представляет собой усеченную форму крестильного мужского имени Емельян (Емилиан), которое имеет греческое происхождение и в переводе на русский язык означает «ласковый, приятный в слове». Кроме того, некоторые исследователи полагают, что это имя ведет свое начало от латинского слова aemulus – «соперник».