Фамилия Меренис — редкая, и её происхождение почти наверняка не русское, а литовское. В русском языке у неё нет привычной суффиксальной модели (-ов, -ин, -ский), которая указывала бы на принадлежность к роду. Окончание -ис — характерный признак литовских фамилий мужского рода в именительном падеже (сравните: Будрис, Лауринавичюс, Сабонис). В русской среде такую фамилию могли записать без изменений, либо, реже, адаптировать в женский вариант Меренисова или Меренисене, но основной формой осталась исходная литовская.

Корень mer- в литовском языке многозначен. Он может восходить к глаголui mirti («умирать») или к существительному mėris («мор», «чума», «повальная болезнь»). В таком случае прозвище Мярнис или Мяренис (лит. Mėrėnis) давали человеку, пережившему эпидемию, либо тому, кто выглядел болезненным, бледным, «заморышем». Есть и менее мрачная версия: mer- может быть связано с глаголом mėgti («любить», «нравиться»), но это предположение слабее, так как словообразовательная цепочка mėgti → Mėrenis встречается реже, чем производные от mirti.

Географически фамилия Меренис тяготеет к западным регионам бывшей Российской империи — к современной Литве, а также к пограничным районам Беларуси и Польши, где исторически жили литовцы. В России носители фамилии — это, скорее всего, потомки переселенцев конца XIX — начала XX века, когда литовские крестьяне и ремесленники уезжали в Сибирь, на Урал или в крупные города. О сословной принадлежности предков сказать сложно: в Литве фамилии на -ис носили и крестьяне, и мелкая шляхта, поэтому без генеалогических документов определить, был ли Меренис землепашцем или боярином, невозможно.

Ударение, вероятно, падает на первый слог — Ме́ренис, что соответствует литовской просодике. На письме фамилия устойчива: варианты вроде Меренис, Меренис, Меренис — это, как правило, ошибки транслитерации, а не самостоятельные формы. Встречается также польская запись Merenis, но это одно и то же.