Фамилия Мерквиладзе имеет грузинское происхождение, на что указывает характерный элемент –дзе, который переводится на русский язык как «сын». Она восходит к топониму Мерквила (Markvila). Этот город находился на территории современной Абхазии. Он указан на карте, составленной английским путешественником Робертом кер Портером в 1821 году.