Фамилия Мерлинкина образована от имени Мерлинка, которое является просторечной формой католического имени Мерлина ("черный дрозд"). Поскольку это имя отсутствует в православном именнике, можно предположить, что родоначальник Мерлинкиных был родом из Западной Европы. В результате, потомок женщины, обладающей именем Мерлинка, со временем получил фамилию Мерлинкина. Процесс формирования фамилий был достаточно длительным, поэтому окончательно говорить о точном месте и времени возникновения рода Мерлинкиных можно лишь на основании генеалогических исследований.