Фамилия Мецеканян — яркий пример армянской модели образования фамилий, но с неочевидной основой. Формант -ян (в старой орфографии -янц) — самый распространённый армянский патронимический суффикс, означающий «принадлежащий к роду», «потомок». В русской записи фамилия сохранила ударение на последнем слоге, что типично для армянских фамилий, усвоенных русским языком.

Сложность в корне «Мецекан». Прямого значения «мецекан» в современном армянском языке нет. Наиболее вероятная версия: основа восходит к армянскому слову «мец» (մեծ) — «большой», «великий», «старший». Суффикс -ек- (-իկ) образует уменьшительные или ласкательные формы, а -ан — суффикс прилагательного. Таким образом, «Мецекан» могло быть прозвищем со значением «большенький», «старшенький» — так в семье могли называть первенца или, напротив, самого рослого. В армянской антропонимии прозвища от прилагательных, обозначающих физические качества, встречаются часто, и эта версия выглядит правдоподобнее всего.

Менее вероятная, но возможная версия — связь с названием профессии или ремесла. В армянском есть слово «мецел» (մեծել) — «увеличивать», «возвеличивать». Теоретически «Мецекан» могло быть прозвищем мастера, который занимался надставкой, наращиванием чего-либо (например, в кузнечном или столярном деле), но лингвистической поддержки эта гипотеза почти не имеет.

По географии фамилия редкая. Её носители встречаются в Армении, в среде армянской диаспоры России и США, но она не входит в число распространённых армянских фамилий. Это говорит о том, что род, скорее всего, небольшой и локальный, возможно, из Западной Армении (исторические области Васпуракан или Сюник), откуда фамилия могла распространиться после геноцида 1915 года.

С точки зрения социального происхождения, фамилия не содержит указания на дворянство или духовное сословие. Типичный армянский патроним на -ян, образованный от прозвища, — признак крестьянского или ремесленного рода, где фамилия закрепилась в XIX веке при массовом учёте населения Российской империи.