Фамилия Мфлов — редкий случай, когда написание расходится с произношением настолько, что затемняет происхождение. Если произнести её вслух, сразу слышится «Мфлов» — глухой звук на стыке. Но в основе, скорее всего, лежит не буква «ф», а оглушённая «в»: исходная форма могла быть Мвлов или Мвалов. Однако ни один из этих вариантов не фиксируется в исторических документах как распространённый, что указывает на другое: фамилия могла возникнуть из прозвища Мфол, Мфёл или Мфала.

Самая правдоподобная версия связывает корень с диалектным глаголом «мфолить» — в северных и сибирских говорах это означало «мямлить, говорить невнятно, бормотать». Прозвище Мфоло или Мфол давали человеку с неразборчивой речью. Суффикс -ов стандартно превратил прозвище в фамилию: «чей?» — Мфолов. Такая модель типична для русских фамилий, образованных от прозвищ с необычной фонетикой.

Альтернативное объяснение — через редкое тюркское имя Мфал (вариант Мфул), которое зафиксировано в некоторых списках казанских татар XVI–XVII веков. Но эта версия слабее: фамилия Мфлов не встречается в Поволжье, а её география (единичные носители в Архангельской, Вологодской областях и в Сибири) совпадает с зоной бытования севернорусских говоров, где «мфолить» было в ходу.

Примечательно, что фамилия не имеет «благородных» параллелей — ни Мфловский, ни Мфлин не существуют. Это говорит о крестьянском или посадском происхождении: прозвище дали в среде, где внешние признаки или особенности поведения были главным способом идентификации. Сегодня Мфлов — одна из редчайших русских фамилий, и её носители, скорее всего, потомки одного человека, получившего меткое прозвище за невнятную речь.