Фамилия Мичигишев — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. Её основа, суффикс и ареал указывают на восточное, скорее всего тюркское или монгольское, происхождение. Разберём её по косточкам.

Словообразовательная модель здесь типична для русских фамилий, но с необычным корнем. Суффикс -ев (после шипящего и мягкого согласного) говорит о том, что фамилия образована как притяжательное прилагательное: «чей?» — Мичигишев, то есть сын или потомок человека по имени или прозвищу Мичигиш. Сама основа «Мичигиш» — это, скорее всего, вариант личного имени или прозвища, бытовавшего у народов Сибири, Прибайкалья или Алтая.

Наиболее правдоподобная версия связывает корень «Мичиги» с бурятским или монгольским языком. В монгольском есть слово «мичиг» (мичих) — «пятно», «родинка», «отметина». Имя или прозвище Мичиги (Мичигэй) могло означать «пятнистый», «с родимым пятном» или, в переносном смысле, «помеченный». Такие имена-описания внешности были распространены у кочевых народов. Форма «Мичигиш» могла возникнуть как ласкательный или уменьшительный вариант (с аффиксом -ш). Есть и менее вероятная версия: связь с тюркским словом «мичик» — «котёнок» (в некоторых диалектах), но она слабее из-за отсутствия широкого распространения такого прозвища.

География фамилии подтверждает сибирский след. Основная масса носителей Мичигишевых исторически зафиксирована в Забайкалье, Бурятии и Иркутской области. Это указывает на то, что предки носителей фамилии, скорее всего, были бурятами, сойотами или представителями других монголоязычных народов, которые вошли в состав Российской империи и получили фамилию по русской модели. В метрических книгах XIX века такие фамилии нередко давали крещёным инородцам по имени отца.

Таким образом, фамилия Мичигишев — это редкий пример, когда тюрко-монгольское прозвище по внешнему признаку (пятно, отметина) превратилось в русскую фамилию с помощью суффикса -ев. Её носители наверняка происходят из среды коренных народов Восточной Сибири, и фамилия эта — прямой маркер их этнической и географической истории.