Фамилия Мичудо — редкая, и её происхождение неочевидно. Словообразовательная модель подсказывает, что перед нами не типичная русская фамилия с суффиксом -ов/-ев или -ин, а скорее фамилия, пришедшая из греческой или южнославянской среды. Окончание -о в русском языке обычно свойственно фамилиям украинского или белорусского происхождения (как Мичудо), но в данном случае основа вызывает вопросы.

Наиболее вероятная версия связывает фамилию Мичудо с греческим именем Михаил. В греческом языке уменьшительно-ласкательные формы имени Михаил могли звучать как Мичу(с) или Мичо, а добавление окончания -до (характерного для некоторых греческих диалектов или для румынского влияния) давало форму Мичудо. То есть фамилия могла означать «потомок маленького Михаила» или просто «Мишенька». В пользу греческого происхождения говорит и то, что фамилии на -удо встречаются у греков Приазовья и греков-понтийцев, переселившихся в Россию в XIX веке.

Менее вероятная, но возможная версия — происхождение от прозвища. В некоторых южнорусских говорах слово «мичуда» могло означать «тихий, скромный человек» (от «мич» — тишина), но это не зафиксировано в словарях и остаётся гипотезой. Также фамилия может быть искажённым вариантом румынской или молдавской фамилии Мичу, где окончание -до прибавилось при адаптации в русской среде.

Географически фамилия Мичудо встречается крайне редко, в основном на юге России и в Краснодарском крае, что подтверждает её причерноморские корни. Сословно предки могли быть греческими переселенцами, занимавшимися торговлей или ремеслом, либо казаками греческого происхождения. Точных данных о дате возникновения фамилии нет, но её форма указывает на то, что она сложилась не ранее XVIII века, когда в Российской империи активизировались миграции греков.