Фамилия Михтунец — редкая, и её разбор не укладывается в привычные схемы русских фамилий. С первого взгляда бросается в глаза суффикс -ец. В русской ономастике этот суффикс часто указывает на происхождение человека по месту жительства: «москвич» → Москвич, «рязанец» → Рязанцев. Однако в случае с Михтунец работает иная модель — это фамилия украинского или белорусского типа, где -ец (или -инец, -унец) образует прозвище от имени или диалектного слова, а не от географического названия.

Основа фамилии — Михтун. Это, скорее всего, производная форма от канонического имени Михаил. В народной речи имя Михаил давало множество уменьшительных вариантов: Михей, Михно, Михута, Михтун. Форма Михтун характерна для западнорусских и украинских говоров, где звук «х» мог заменять «ф» или «в», а суффикс -ун придавал имени оттенок ласкательности или, наоборот, ироничной грубоватости. Таким образом, Михтунец — это «сын Михтуна» или «человек из рода Михтуна».

Вторая версия, менее вероятная, но допустимая: связь с диалектным словом «михтю́к» или «михту́н». В некоторых говорах так называли медлительного, неуклюжего человека, реже — того, кто постоянно хмурится. Однако в ономастике принято сначала искать имя собственное в основе, и имя Михаил здесь лежит на поверхности.

География фамилии узкая. Михтунец встречается почти исключительно на западе Украины (Волынь, Ровенская область) и в приграничных районах Беларуси. В России эта фамилия — единичная, чаще всего результат миграции в советское время. Фамилия не попала в массовые списки дворянских или купеческих родов, её носители — почти наверняка крестьянского или мещанского происхождения, что типично для фамилий на -ец, закрепившихся в XIX веке при переписях населения.

Любопытная деталь: если бы фамилия писалась через «о» — Михтуно́к или Михтунко́в, она была бы более привычной для русского уха. Но форма Михтунец с ударением на второй слог сохранила живую диалектную основу и не подверглась русификации. Это один из тех случаев, когда фамилия — прямое свидетельство того, на каком наречии говорили предки.