Фамилия Микнявичус — яркий пример литовской фамилии, адаптированной в русской языковой среде. Она образована по типичной для литовской антропонимии патронимической модели: к основе имени или прозвища добавляется суффикс -явичус (литовский вариант -avičius, который в свою очередь восходит к -avič- с добавлением латинского -ius, характерного для знатных родов Великого княжества Литовского). Таким образом, Микнявичус означает «сын Микняса» или «потомок Микняса».

В основе фамилии лежит личное имя Микняс — уменьшительная форма от распространённого в Литве имени Миколас (литовский аналог Николая). Имя Миколас, как и русский Николай, происходит от греческого «Николаос» — «победитель народов». В литовском языке такие уменьшительные формы, как Микняс, были обычны для повседневного общения, а затем закреплялись в фамилиях. Суффикс -явичус указывает, что фамилия сформировалась в среде литовской шляхты или зажиточных крестьян, поскольку именно в этих слоях была принята трёхчленная модель именования с окончанием на -ус.

Географически фамилия Микнявичус наиболее характерна для восточной и центральной Литвы, особенно для регионов, исторически связанных с Вильнюсским краем. После вхождения этих земель в состав Российской империи в конце XVIII — XIX веках, многие литовские фамилии адаптировались к русской грамматике: в документах окончание -ус часто сохранялось, но фамилия склонялась по правилам русского языка. Встречаются варианты написания — Микнявичюс (с литовским диакритическим знаком) или Микнявичус (в русской транскрипции).

Родственные фамилии — Микнявич, Микнюс, Микнис — указывают на ту же основу, но с другими суффиксами, что говорит о разных этапах формирования или о региональных особенностях. Носитель фамилии Микнявичус, скорее всего, происходил из семьи, где имя Микняс передавалось из поколения в поколение, а сама фамилия закрепилась в эпоху, когда литовская знать начала фиксировать родовые прозвания.