Фамилия Милоенко относится к распространенному типу украинских фамилий и образована от крестильного имени Иммануил. Имя Мило является производной формой имени Иммануил (Мануил). Оно в переводе с древнееврейского это имя означает «с нами Бог». Одним из покровителей этого имени считался святой мученик Мануил, который вместе с Феодосием пострадал за веру во Христа в 304 году в Сирмии. После долгих мучений они были обезглавлены. Поэтому Милоенко буквально понималось как «сын Мило».