Фамилия Минаильченко — яркий пример украинской модели фамилии, образованной от имени через цепочку суффиксов. Основа здесь — крестильное имя Минаил, редкий вариант канонического имени Михаил. В народной речи имя Михаил часто сокращали и переиначивали: Минай, Минаил, Мина. От такой формы и пошла фамилия.

Суффикс -енко — типичный украинский патронимический показатель, означающий «сын» или «потомок». Но в Минаильченко не один, а два суффикса: сначала -иль (уменьшительно-ласкательный или прозвищный), а затем -ченко, который присоединился к основе Минаил-. Получается, что фамилия буквально значит «сын Минаила», то есть потомка человека, которого в быту звали Минаилом.

Географически фамилия тяготеет к центральным и восточным областям Украины, а также к югу России, куда в XVIII—XIX веках переселялись украинские крестьяне и казаки. Встречается она нечасто, что говорит о локальном происхождении: вероятно, предок носителя был заметным человеком в небольшом селе или хуторе, и его прозвище закрепилось за целым родом.

Интересно, что форма Минаильченко могла возникнуть и под влиянием церковнославянского произношения имени Михаил — Минаил, где «х» перешло в «н» под влиянием акающих говоров. В любом случае, фамилия однозначно указывает на украинские корни и на то, что родоначальника звали Михаилом, но в быту его называли ласково или сокращённо Минаилом.