Фамилия Мипакова — довольно редкая, и её происхождение не лежит на поверхности. В русской ономастике фамилии, оканчивающиеся на -аков, чаще всего отталкиваются от слова с суффиксом -ак. В данном случае основа — Мипак. Это могло быть прозвище или мирское имя, которое давали человеку по какой-то характерной черте.

Самый вероятный путь образования — от прозвища, связанного с глаголом «мипать». В некоторых северных и сибирских говорах это слово означало «мигать», «щуриться» или «смотреть прищурившись». Человека с такой привычкой или особенностью зрения могли прозвать Мипаком. Суффикс -ак в русских прозвищах часто придавал оттенок просторечия или указывал на носителя признака (ср. «зряк» от «зреть», «мигак» от «мигать»). Соответственно, Мипаков — сын или потомок Мипака.

Менее распространённая, но возможная версия — связь с тюркскими корнями. В тюркских языках есть слова, звучащие как «мип» или «мипа», которые могли означать что-то вроде «метка», «знак» или быть частью личного имени. Однако для фамилии Мипакова, которая явно оформлена по русской модели (суффикс -ов), такая версия менее правдоподобна без документального подтверждения миграции носителей.

Географически фамилия Мипакова встречается в основном в центральных и северных областях России, особенно в Вологодской и Архангельской губерниях исторически. Это косвенно подтверждает первую версию: именно в тех местах диалектное слово «мипать» было в ходу. Встречается она и в варианте Мипаков — для мужского рода.

Таким образом, предок современных Мипаковых, скорее всего, был человеком с характерной манерой щуриться или прищуривать глаза, за что и получил своё прозвище. Фамилия не принадлежала к дворянским или купеческим — это типичная крестьянская или мещанская фамилия, образованная от уличного прозвища.