Фамилия Мирходжаев — одна из тех, что сразу выдают восточное, а точнее — тюрко-персидское происхождение. Она не имеет отношения к русским прозвищам или ремеслам, а образована по арабо-персидской модели сложения двух корней. Разберем её по частям.

Первая часть — «Мир». В арабском и персидском языках это слово может означать «князь», «господин», «предводитель», но чаще в составных именах оно восходит к сокращению от «амир» (эмир, повелитель). Вторая часть — «Ходжа» (или «Хаджи»). Это почетный титул, который на Востоке давали человеку, совершившему паломничество в Мекку (хадж), или же просто уважаемому купцу, наставнику, учителю. Таким образом, имя Мирходжа (а фамилия Мирходжаев — это «сын Мирходжи») буквально означает «господин, совершивший хадж» или «князь-паломник». Это составное имя было распространено в среде исламского духовенства и зажиточных торговцев в Средней Азии.

Суффикс «-ев» — типичный русский патронимический суффикс, который присоединялся к фамилиям народов, вошедших в состав Российской империи, при русификации документов. В оригинале, без русского окончания, фамилия звучала бы как Мирходжаев, где «-ев» указывает на принадлежность (чей? — Мирходжаев). В узбекской и таджикской традиции аналогичная фамилия могла бы писаться как Мирходжаев или Мирходжа.

Носители фамилии Мирходжаев в основном сосредоточены в Узбекистане, Таджикистане, а также в южных регионах Казахстана и Кыргызстана. В России эта фамилия встречается редко, чаще всего в среде выходцев из этих стран. Встречаются варианты написания с одной «д» (Мирхожаев) или с ударением на последний слог, но это уже особенности местных говоров.

С точки зрения социальной истории, предки человека с такой фамилией, скорее всего, были людьми грамотными и уважаемыми в своей общине: либо религиозными деятелями (ишанами, муллами), либо состоятельными купцами, имевшими возможность совершить хадж, что в досоветское время было привилегией и знаком высокого статуса. Фамилия не указывает на конкретное ремесло, но четко говорит о религиозной и культурной традиции рода.