Фамилия Мирзамагомедов — яркий образец арабо-персидского именослова, прижившегося на кавказской почве. Её основа — составное мусульманское имя Мирзамагомед, где соединились два элемента: «мирза» (от персидского «амир-заде» — «сын эмира», «принц», позже — почтительное обращение к грамотному человеку или писцу) и «Магомед» (арабская форма имени пророка Мухаммеда, означающая «восхваляемый», «достойный хвалы»). Таким образом, в буквальном смысле имя Мирзамагомед можно перевести как «господин (или потомок знатного рода) по имени Магомед».

Образована фамилия по русской модели с патронимическим суффиксом -ов. Мирзамагомедов — буквально «сын Мирзамагомеда». Интересно, что в отличие от многих русских фамилий, где суффикс крепится к полной форме имени, здесь мы видим сохранение исходного сложного имени целиком. Это типично для фамилий, возникших в среде народов Северного Кавказа и Закавказья, где русская административная машина в XIX–XX веках фиксировала фамилии по отчеству, не усекая и не переделывая длинные мусульманские имена.

Географически фамилия Мирзамагомедов почти наверняка указывает на происхождение из Дагестана, реже — из Чечни или Азербайджана. В Дагестане, особенно у аварцев, даргинцев и лезгин, составные имена с компонентом «мирза» были распространены среди духовенства и зажиточных слоёв: так могли назвать сына в семье, где ценили образованность и религиозность. Встречаются однокоренные фамилии Мирзаев, Мирзаханов, Магомедов — но Мирзамагомедов стоит особняком, так как склеивает два социально значимых титула в одном родовом имени.

Стоит заметить, что в русском языке фамилия склоняется по мужскому роду (Мирзамагомедова, Мирзамагомедову), а женский вариант — Мирзамагомедова — остаётся неизменяемым. В среде носителей фамилии часто встречается неформальное сокращение «Мирза» — это не отдельная фамилия, а привычное для Кавказа усечение длинного родового имени до первого слога.