Фамилия Мизиркина встречается нечасто, и её происхождение — хороший пример того, как за простым звучанием может скрываться неочевидная история. Основа фамилии — слово «мизирка». В русских говорах, особенно рязанских и тамбовских, так называли мелкую, невесомую рыбёшку, малька, а в переносном смысле — маленького, щуплого, невзрачного человека. Прозвище Мизирка давали либо низкорослому мужчине, либо тому, кто занимался ловлей такой рыбы или жил у мелководного водоёма.

Слово «мизирка» — родственное диалектному «мизгирь», что в некоторых областях означало паука. Связь прослеживается через общий корень: «миз-» со значением чего-то мелкого, крошечного. В таком случае прозвище могло указывать на человека суетливого, «паучьего» склада характера или на того, кто ткал сети (сравните с фамилией Мизинов, от «мизинный» — маленький). Однако версия с рыбой более распространена и подкреплена географией бытования фамилии.

Фамилия образована по стандартной русской модели: прозвище Мизирка + суффикс принадлежности -ин, указывающий на «сына Мизирки» или «человека из семьи Мизирки». Форма Мизиркина — женская, мужской вариант — Мизиркин. Поскольку суффикс -ин типичен для центральных и северных губерний России, предки носителей фамилии, скорее всего, жили в нечернозёмной полосе или в Поволжье, где рыболовство было подсобным промыслом.

Стоит отметить, что фамилия не имеет отношения к тюркским языкам, хотя звучит похоже на некоторые восточные имена. Это исконно русское образование от диалектного слова, которое сейчас почти вышло из употребления. В дореволюционных источниках фамилия фиксируется в основном среди крестьян и мещан, что логично: прозвища по внешним признакам или роду занятий были характерны для низших сословий. Никаких дворянских родов Мизиркиных не известно — это фамилия простого человека, прозванного за малый рост или за промысел, связанный с мелкой рыбёшкой.