Фамилия Млтыхян не встречается ни в одном серьёзном ономастическом справочнике по русским или армянским фамилиям — ни у Унбегауна, ни у Никонова, ни у Суперанской. Это не случайное упущение: такой фамилии в доступных научных источниках просто нет. Перед нами либо редчайшая локальная фамилия, зафиксированная только в отдельных семьях, либо — что вероятнее — искажённое написание более известной фамилии.

Если предположить, что это армянская фамилия (суффикс -ян указывает на армянское происхождение), то основа «Млтых» не имеет прямого аналога в армянском языке. В армянском нет распространённых корней, которые давали бы такую форму. Возможно, это результат ошибки при записи или опечатки. Ближайшие по звучанию армянские фамилии — Млтчян или Млтычян, но и они крайне редки и не документированы в словарях. В таком случае фамилия могла произойти от прозвища, связанного с диалектным словом, или быть топонимической — от названия села или местности, которое не сохранилось в письменных источниках.

Другой вариант: фамилия могла возникнуть в русскоязычной среде как результат искажения при переписи или в документах. Например, исходная фамилия могла быть Молтыхян или Малтыхян, где первый слог со временем редуцировался до «Мл-». Такое упрощение встречается в устной речи и при записи «на слух». Если это так, то корень мог восходить к тюркскому или кавказскому слову, которое в русской передаче потеряло гласную.

Третья гипотеза — фамилия могла быть искусственно создана или изменена в советское время, когда многие носители меняли фамилии по разным причинам. В таких случаях возникали формы, не поддающиеся стандартной этимологии.

Проверить эти версии можно только через семейные архивы или записи в метрических книгах конкретного региона. Пока же фамилия Млтыхян остаётся ономастической загадкой: её происхождение неясно, а носители, скорее всего, единичны. Если вы встретили её в документах или среди знакомых, стоит уточнить, не было ли у предков другого написания — это может прояснить историю.