Фамилия Млюнко звучит редко и необычно для русского уха, но её происхождение укладывается в типичную для украинской и белорусской ономастики модель. Суффикс -ко характерен для фамилий, образованных в западнорусских землях и на территории современной Украины: он часто указывал на уменьшительную или прозвищную форму. Основа Млюн- — вот что требует разбора.

Скорее всего, в основе лежит диалектное слово «млюн» или «млюнь». В западных говорах так могли называть человека медлительного, вялого, «млющего» — то есть делающего что-то неспешно, с ленцой. Есть и другая версия: «млюн» — вариант слова «млин» (блин), но с характерным для некоторых говоров переходом «и» в «ю». Тогда Млюнко — это «тот, кто печёт блины» или прозвище человека с круглым, «блинным» лицом. Третья, менее вероятная гипотеза — связь с литовским или польским корнем, означающим «глина» (лит. molis, пол. glina), но для этого нужны прямые доказательства бытования фамилии на пограничье.

Географически фамилия Млюнко встречается прежде всего на западе Украины — в Волынской, Ровенской, Львовской областях, а также у переселенцев в соседних регионах Беларуси. В России она крайне редка и, как правило, фиксируется у потомков выходцев из тех мест. Сословной принадлежности у фамилии нет: её могли носить и крестьяне, и казаки, и мещане, поскольку прозвищный тип образования был всесословным.

С точки зрения словообразования фамилия Млюнко — типичный представитель модели «прозвище + -ко». Суффикс здесь не фамильный в современном смысле, а скорее уменьшительно-ласкательный или даже пренебрежительный, как в украинских именах Петро — Петрусь — Петрунько. Со временем такое прозвище закрепилось за потомками и перестало восприниматься как описательное.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями, то можно вспомнить Млюн, Млюнов, Млюнский — все они редки и, скорее всего, имеют общий корень. Но именно форма Млюнко — самая характерная для западных земель, где суффикс -ко стал одним из главных маркеров фамильной идентичности.