Фамилия Молдахметов образована от личного имени Молдахмет — и это тот редкий случай, когда в основе лежит не прозвище и не профессия, а духовный сан. Имя составное: казахское «молда» означает «мулла», а арабское «ахмет» (восходящее к имени Ахмад) переводится как «самый знаменитый, прославленный». Вместе это читается как «достойный похвал мулла» или «прославленный мулла». Муллой называли настоятеля мечети — человека, который руководил богослужением, учил детей грамоте и выполнял роль судьи в бытовых спорах. В казахской степи молда был не просто священнослужителем, а часто единственным грамотным человеком в ауле, к которому шли за советом и за письмом.

Такое имя давали не случайно: родители либо посвящали сына служению, либо выражали надежду, что он вырастет человеком учёным и уважаемым. В отличие от многих фамилий, возникших из крестьянских прозвищ, Молдахметов сразу указывает на связь с исламской традицией и образованностью. Суффикс -ов, присоединённый к имени, — стандартная русская модель образования фамилий, которая закрепилась у казахов в XIX–XX веках, когда при документальном оформлении к тюркским именам добавляли русские окончания.

Архивные записи подтверждают, что фамилия бытовала в разных регионах Казахстана и Западной Сибири. В архивах УВД Омской области записан Молдахметов Альжан, родившийся в 1886 году (Омская область, Азовский район). Из Сведений ДКНБ РК по Северо-Казахстанской области известен Молдахметов Сейтказы, рождённый в 1895 году (Северо-Казахстанская область, Октябрьский район, Кенес). В Сведениях ДКНБ РК по Алматинской области упоминается Молдахметов Тлеубек, рождённый в 1906 году (Карагандинская область, Кувский район, аул 14). Эти разбросанные по документам имена показывают, что фамилия не была привязана к одному роду или местности — носители встречались от Омска до Алматы.

Любопытно, что фамилия сохранила двойное написание корня: в одних документах пишут «Молдахметов», в других можно встретить «Мулдахметов» — это следы разного произношения одного и того же имени. Казахское «молда» при переносе в русскую письменность иногда передавали через «у», что отражало диалектное звучание. Такие колебания типичны для фамилий, которые фиксировали со слов самих носителей при переписях и оформлении паспортов.

Если говорить о родственных фамилиях, то Молдахметов стоит в одном ряду с Молдабаевым, Молдагалиевым и Молдакуловым — все они образованы от имён с той же основой «молда». Но если Молдабаев буквально означает «богатый мулла», а Молдакул — «раб муллы» (в смысле «слуга Божий»), то Молдахмет выделяется тем, что вторая часть имени не описывает социальный статус, а прославляет самого человека. Это делает фамилию не просто указанием на род занятий предка, а своего рода благопожеланием, зашифрованным в имени.