Фамилия Молджанова — женская форма фамилии Молджанов, и её разбор стоит начать с самого необычного элемента: суффикса -джан-. Эта часть прямо указывает на тюркское происхождение. В тюркских языках «джан» (can, jan) означает «душа», «жизнь» или используется как ласковое обращение, вроде «милый», «дорогой». В русских фамилиях такие суффиксы встречаются редко и почти всегда сигнализируют о том, что основа была заимствована из татарского, башкирского, азербайджанского или других тюркских языков, а затем русифицирована с помощью окончания -ов/-ев.

Первая часть фамилии — «Молд». Здесь возможны два объяснения, и оба ведут в одну сторону. Самое прямое: «Молд» — это искажённое или фонетически адаптированное тюркское «мулда», «молда» или «молла». Так в Поволжье и Средней Азии называли грамотного человека, знатока Корана, религиозного учителя или писаря. Слово восходит к арабскому «мауля» (господин, владыка) и через персидское посредничество попало в тюркские языки. Вторая версия: «Молд» может быть вариантом имени Мулда — личного имени, образованного от того же корня. То есть прозвище Молда или Мулда получал либо человек духовного звания, либо просто начитанный и уважаемый односельчанин.

Сложив части, получаем: «Молд» (молла, учитель) + «джан» (душа, дорогой) = Молджан. Это составное прозвище или имя, которое можно перевести как «дорогой, как молла», «почтенная душа» или просто «уважаемый человек». В тюркской среде такие двусоставные имена с компонентом «джан» — обычное дело (например, Алмазджан, Гульджан). Позже, когда носитель прозвища попал в русскоязычную среду, фамилию оформили по стандартной модели: к основе Молджан добавили русский патронимический суффикс -ов, получился Молджанов, а для женщин — Молджанова.

Географически фамилия тяготеет к регионам с сильным татарским и башкирским влиянием: Татарстан, Башкортостан, Оренбургская область, а также встречается в Закавказье, особенно в Азербайджане, где суффикс «джан» — часть повседневного общения. По сословной принадлежности предки Молджановых, скорее всего, относились к государственным или служилым крестьянам, либо к духовному сословию (муллы и их семьи), но не к дворянству — в дворянских родословных книгах фамилия не фиксируется.

Интересная деталь: написание через «о» (Молджанова) вместо ожидаемого «Мулджанова» — результат аканья или местного произношения, когда безударный звук редуцировался. В дореволюционных метрических книгах можно встретить оба варианта, но современная орфография закрепилась с «о».