Фамилия Моловкина — женская форма, а её мужской вариант — Моловкин. В основе фамилии лежит прозвище или нецерковное имя Молвка, которое, скорее всего, происходит от глагола «молвить» — говорить. В старину «молвой» называли не просто речь, а слух, толки, молву. Человек мог получить прозвище Молва или Молвка за разговорчивость, склонность распускать новости или, наоборот, за неожиданную молчаливость — в диалектах встречалось ироничное «молва» в значении «тихоня».

Суффикс -кин в фамилии указывает на принадлежность: Моловкин — «чей?» — сын или потомок Молвки. Модель образования типична для русских фамилий XVI–XVII веков, особенно в северных и центральных губерниях. Встречаются и однокоренные фамилии — Молвин, Молвов, Молчанов, но Моловкин стоит особняком: здесь корень не в «молчании», а именно в «молве» с чередованием в/вк.

В писцовых книгах и ревизских сказках эта фамилия фиксируется редко, что говорит о её локальном бытовании. По косвенным данным, Моловкины могли быть крестьянами или посадскими людьми из районов Вологодчины или Поволжья, где диалектное слово «молвка» сохранялось дольше. В XIX веке фамилия встречается в единичных записях по Казанской и Вятской губерниям.

Есть и менее вероятная версия: связь с тюркским словом «мол» (скот) через промежуточное прозвище Молов — но для суффикса -кин это нетипично, так как от тюркских основ чаще образовывали фамилии на -ов. Поэтому происхождение от «молвить» остаётся основным.