Фамилия Молтояков — одна из тех, что сразу привлекает внимание необычным звучанием. Она редкая, и её происхождение напрямую связано с этнической историей Сибири. С высокой долей вероятности, это русифицированная форма хакасской или шорской фамилии, образованная от имени Молтой или прозвища Молтойак.

Разберём словообразовательную модель. Основа фамилии — «Молтояк». Суффикс «-ов» в данном случае работает как типичный русский патронимический суффикс, присоединённый к тюркскому корню. Такая модель была массовой в XIX–XX веках, когда коренное население Южной Сибири получало русские фамилии: к исходному имени добавляли окончание, привычное для русских документов. Без этого суффикса фамилия звучала бы как Молтояк — именно так, вероятно, звали родоначальника.

Значение корня «молто» в тюркских языках Хакасии и Горной Шории неоднозначно. Наиболее правдоподобная версия связывает его с понятием «молт» — «кремень» или «твёрдый, крепкий». В таком случае Молтояк — это человек, которого прозвали Кремнём за твёрдость характера или неуступчивость. Менее вероятна, но возможна связь с диалектным «молт» в значении «глухой звук» или «тупой» — такое прозвище могли дать неразговорчивому человеку. В любом случае, основа — личное прозвище, а не имя из исламского или христианского календаря, что типично для родовых имён народов Саяно-Алтая.

Географически фамилия Молтояков почти наверняка привязана к территории Хакасии (особенно Аскизский и Таштыпский районы) или юга Кемеровской области (Горная Шория). Встречаемость за пределами этих мест крайне низкая, и если носитель фамилии живёт в европейской части России, его предки, скорее всего, мигрировали оттуда в советское время. Социальный контекст: предки носителя фамилии были скотоводами или охотниками, входили в состав определённого сеока (рода). Фамилия фиксирует родовую принадлежность, а не сословие — среди хакасов и шорцев не было дворянства в привычном русском понимании.

Сравнение с однокоренными фамилиями даёт дополнительную информацию. Встречаются варианты Молтояков, Молтояшев, а также фамилии с основой «Молт-» без суффикса — Молтов. Если бы корень был «Молтой», то фамилия звучала бы как Молтоев, но наличие «-як» в основе указывает на уменьшительную или ласкательную форму имени (Молтой + ак = Молтойак, то есть «маленький Молтой» или «Молтой-сын»). Таким образом, фамилия буквально означает «потомок маленького Молтоя» или «сын человека по прозвищу Кремень». Это редкий случай, когда в фамилии сохранилась не только основа, но и внутренняя тюркская аффиксация, поверх которой наложился русский суффикс.