Фамилия Молтрунчик — редкая и по звучанию напоминает выходцев с запада славянского мира, скорее всего, из Беларуси или Украины. Её основа и суффикс указывают на прозвищное происхождение, а не на связь с каким-либо известным ремеслом или географическим названием.

Разберём словообразовательную модель. Суффикс -чик в восточнославянских фамилиях (Молтрунчик, Гончарчик, Шевчик) часто указывает на уменьшительную или сыновью форму. Он мог означать «сын Молтруна» или «маленький Молтрун». Сама основа Молтрун — прозвище, которое, скорее всего, происходит от диалектного глагола «молтрунить» или «молтрухать». В белорусских и украинских говорах эти слова означают «мямлить», «говорить невнятно», «бормотать» или «медлить, делать кое-как». Человек с таким прозвищем мог быть неспешным, неразговорчивым или с нечёткой речью.

Есть и вторая, менее вероятная версия. Корень «молт-» может быть искажением от «молот-» (молотить, молоток). В таком случае прозвище Молтрун мог получить кузнец или крестьянин, занятый молотьбой. Однако переход «т» в «л» в этой позиции нехарактерен для славянской фонетики, поэтому версия с «бормотанием» или «медлительностью» выглядит убедительнее.

Географически фамилия тяготеет к западным областям Беларуси (Гродненская, Брестская области) и, возможно, к восточным воеводствам Польши (Подляшье), где были распространены фамилии с суффиксом -чик. В России она встречается единично, чаще всего как результат миграции в XX веке.

В отличие от фамилий на -ов/-ев, которые давали по отцу-землевладельцу или по профессии, Молтрунчик — это «уличное» прозвище, закрепившееся за родом. Оно не указывает на высокое сословие: предки носителя, скорее всего, были крестьянами или мещанами, а прозвище им дали соседи за какую-то заметную черту характера или поведения.