Фамилия Морницин — редкий пример, где труднее всего разобрать не корень, а суффиксальную часть. На первый взгляд, перед нами типичная модель на -ин, указывающая на принадлежность: «чей?» — сын Морницы. Но вот с основой «Морница» всё не так просто. В русских говорах слово «морница» не зафиксировано ни как ремесло, ни как прозвище, ни как название жилища. Поэтому основная версия — нестандартное усечение от более длинного имени или прозвища.

Самое правдоподобное объяснение — исходная форма Морни́ца (с ударением на второй слог) является кратким вариантом имени Морни́слав. Такие имена — Морнислав, Морнислава — хоть и редки, но встречаются в древнерусской антропонимии. Корень «мор-» здесь связан с морем или с древним значением «смерть, мор» (от общеславянского *morъ). В пользу этой версии говорит то, что фамилия на -ин от полного славянского имени — обычное дело (ср. Тверитин → Тверицын, Любим → Любимцев). Морницин мог возникнуть как «сын Морницы», где Морница — домашняя форма, вроде Томила от Томило, Ратша от Ратибор.

Вторая гипотеза — диалектная. В некоторых западных и южнорусских говорах «морницей» могли в шутку называть человека, который «морит» — морит голодом, изводит работой или, наоборот, сам выглядит измождённым. Но это предположение слабое: нет письменных подтверждений такого прозвища, а словообразовательная модель «мор- + -ица» даёт скорее название предмета («морилка»), а не человека.

Географически фамилия Морницин крайне локальна. Единичные носители фиксируются в старых переписях Вологодской и Костромской губерний — регионах, где сохранялись архаичные личные имена. Сословно, скорее всего, это крестьянская или мещанская фамилия: дворянские роды с таким окончанием обычно имеют более прозрачную этимологию (от географических названий или прозвищ).

Сравнение с однокоренными фамилиями подсказывает, что Морницин стоит особняком. Морозов, Морозкин, Моряков — все они ясны по смыслу. А Морницин, вероятно, единственный в своём роде, кто сохранил память о забытом славянском имени.