Вероятнее всего, основатель рода Московченко был коренным жителем этого города, позже переселившимся на территорию Украины, о чем свидетельствует характерный суффикс -енко. Соответствия гидрониму Москва имеются и в других славянских землях: река Московица (Московка), в селе Березины; ручей Московець на Украине, реки Моzgawa или Moskawa в Польше и Германии. Менее вероятно, что в основе фамилии Московченко лежит название небольшого села в Болгарии — Московец. Оно находится в Пловдивской области, входит в общину Карлово.