Фамилия Мраморита — редкая и нестандартная для русского ономастикона. Её происхождение почти наверняка не связано с русским просторечием или прозвищем по камню «мрамор». В исконно русских фамилиях суффикс -ита практически не встречается: типичны окончания -ов, -ев, -ин, -ский. Мраморита явно выбивается из этого ряда.

Скорее всего, перед нами фамилия искусственная или книжного происхождения. В Российской империи такие фамилии давали выпускникам духовных семинарий. Семинаристам нередко присваивали «благозвучные» фамилии на греческий или латинский манер: от названий камней, растений, абстрактных понятий. Мраморита могла быть образована от греческого «мармарос» (μάρμαρος) — «мрамор, блестящий камень» — с добавлением окончания -ита, которое в европейских языках часто означает принадлежность к минералу (кальцит, барит, малахит). Таким образом, фамилия могла означать «мраморный», «подобный мрамору» — как символ чистоты, твёрдости или красоты.

Вторая, менее вероятная версия — фамилия могла возникнуть как русифицированная форма итальянской или греческой фамилии Marmorita. В таком случае её принесли в Россию переселенцы или специалисты (например, камнетёсы, скульпторы), но массового распространения она не получила. Поскольку фамилия нигде не фиксируется как распространённая, скорее всего, её носители — потомки одного человека, получившего такую «кабинетную» фамилию в стенах духовного училища в XIX веке.