Фамилия Мшгушина — редкий случай, когда написание почти полностью скрывает корень. На первый взгляд, перед нами сочетание согласных «мшг», нетипичное для русского языка. Скорее всего, мы имеем дело с искажением исходной формы при записи в документах. Вероятнее всего, фамилия образована от прозвища или имени, которое в устной речи звучало иначе, а на письме закрепилось в упрощённом или ошибочном виде.

Самая правдоподобная версия: основа — «Мшгуш» или «Мшгуша», что могло быть вариантом тюркского имени или прозвища. В тюркских языках корни «мыш»/«мш» (например, «мышык» — кошка) или «муш» (в значении «сильный», «крепкий») встречаются. Суффикс «-уш» характерен для уменьшительно-ласкательных форм в южнорусских и украинских говорах: «Мшгуш» — как «дедуш», «батюш». Тогда «Мшгуша» — это человек, которого так называли в быту. Суффикс «-ин» указывает на принадлежность: «чей?» — Мшгушин, то есть сын или потомок Мшгуши.

Менее вероятно, но стоит упомянуть: фамилия могла возникнуть от названия населённого пункта с похожим корнем, но таких топонимов в доступных источниках не зафиксировано. Также не исключено, что это результат слияния двух основ (например, «Мша» + «Гуша»), но такое объяснение искусственно.

География фамилии Мшгушина крайне узкая. По данным открытых источников, носители встречаются в основном в Поволжье и на Южном Урале — регионах, где исторически смешивались русское, тюркское и финно-угорское население. Это косвенно подтверждает версию о тюркском происхождении основы.

С точки зрения сословной принадлежности, фамилия не даёт подсказок: суффикс «-ин» типичен и для крестьянских, и для мещанских, и для дворянских фамилий. Никаких упоминаний о знатных родах Мшгушиных в исторических хрониках нет — скорее всего, это фамилия простых людей, чьё прозвище со временем закрепилось в официальных бумагах.

Таким образом, фамилия Мшгушина — это, скорее всего, русифицированная форма тюркского прозвища, записанная «на слух» с возможным искажением. Её носители — потомки человека по прозвищу Мшгуша, жившего, вероятно, на стыке культурных миров.