Фамилия Мсинузутдинов — редкий пример сложносоставной фамилии, где основа, судя по всему, восходит к арабскому имени через тюркское посредничество. Разобрать её проще всего, если заметить, что она состоит из двух частей: «Мсинуз» и «утдин». Вторая часть, «-утдин», — это фонетический вариант арабского «ад-дин» (вера, религия), очень частый компонент в мусульманских именах и фамилиях (сравните: Нуртдинов, Валиутдинов, Гайнутдинов). Первая часть «Мсинуз» — наиболее спорная и редкая. Вероятнее всего, это искажённое или диалектное произношение имени «Маснур» или «Маснуз», которое в свою очередь восходит к арабскому «Масрур» (весёлый, радостный). В тюркских языках (татарском, башкирском) звук «р» на конце слова иногда переходит в «з» или выпадает, а начальное «Ма-» могло редуцироваться до «М-» перед шипящим. Таким образом, исходное имя могло звучать как Маснуруддин — «радость веры». Фамилия образована по стандартной русской модели с суффиксом -ов, который добавляется к тюркскому имени, превращая его в фамилию: «сын такого-то». Географически фамилия почти наверняка привязана к татаро-башкирской среде, скорее всего, к южному Уралу или Волго-Уральскому региону, где подобные сложные теофорные имена были распространены. Необычное написание «Мсинуз-» вместо ожидаемого «Маснур-» или «Маснуз-» может указывать на запись фамилии в документах «на слух», с сильным редуцированием первого гласного. Других версий, кроме этой, для такой редкой фамилии не существует — корень «Мсинуз» не встречается ни в одном из известных тюркских или арабских словарей как самостоятельное слово.