Фамилия Муандза — редкая и нестандартная для русского слуха. Её происхождение с высокой вероятностью связано с африканским регионом, а именно с бантуязычными народами. В языках группы банту (суахили, лингала, киконго и других) корень «муан» или «муана» часто означает «ребёнок» или «дитя». Так, в суахили «mwana» (произносится «муана») — это «ребёнок», «потомок». Окончание «-дза» может быть вариантом транслитерации распространённого суффикса или части имени, указывающей на принадлежность или происхождение. Таким образом, фамилия Муандза, скорее всего, восходит к личному имени или прозвищу, которое давали человеку как «ребёнку» или «сыну» кого-либо. В некоторых культурах Конго и Анголы подобные имена (например, Муанду, Муанза) фиксируются как родовые.

Модель образования фамилии — не русская, а заимствованная. В русском языке нет суффикса «-дза», поэтому носители фамилии Муандза в России — это, как правило, люди, чьи предки прибыли из стран Центральной или Южной Африки. Встречается фамилия и в среде потомков смешанных браков, а также у эмигрантов из бывших португальских колоний (Ангола, Мозамбик), где португальская запись могла исказить местное произношение. В португальском языке сочетание «ndz» передаётся как «nz» или «ndz», что и дало форму «Муандза».

Вторую, менее вероятную версию можно связать с японским языком, где существует фамилия Муан (например, 武安) с разными иероглифами, но окончание «-дза» для японских фамилий нетипично. В любом случае, для русского уха фамилия звучит экзотично и однозначно указывает на нерусское, скорее всего африканское, происхождение предков. География бытования в России — единичные случаи, в основном в крупных городах (Москва, Санкт-Петербург) среди потомков иностранных студентов или специалистов XX века.