Фамилия Мубарекшенова — редкий случай, когда женская форма сохранилась в качестве основной в официальных документах, хотя по происхождению это, безусловно, фамилия, образованная от мужского имени. В русской традиции фамилии на -ов/-ев, -ин обычно давались по отцу, и женская форма Мубарекшенова — это именно «дочь» или «жена Мубарекшена».

Основа фамилии — составное арабо-персидское имя Мубарекшен. Первая часть, «Мубарек», восходит к арабскому «мубарак» — благословенный, счастливый. Вторая часть, «шен», — персидский компонент, означающий «достойный», «подходящий», «украшающий». В целом имя Мубарекшен можно перевести как «достойный благословения» или «тот, чьё благословение украшает». Это типичная для мусульманского Востока модель имяобразования, где два корня сливаются в одно имя с возвышенным смыслом.

Суффикс -ов(а) в данном случае — славянский, он указывает на то, что фамилия складывалась в русскоязычной среде, скорее всего, у татар, башкир или других тюркских народов Поволжья и Приуралья, где были распространены исламские имена. Фамилия могла закрепиться за потомками человека по имени Мубарекшен, который, возможно, был муллой, купцом или просто уважаемым человеком в общине. Географически такая фамилия наиболее вероятна в Татарстане, Башкортостане, Оренбургской или Челябинской областях.

С точки зрения словообразования интересно, что фамилия не прошла этап усечения или русификации: полное имя стало основой без изменений. Это отличает её от многих татарских фамилий, где «Мубарак» мог превратиться в Мубаракова или Мубаракшина. Вариант Мубарекшенова сохранил оригинальную двусоставную структуру, что делает её ценной для ономастики как пример прямого переноса мусульманского личного имени в русскую фамильную модель.

Встречаемость фамилии крайне низкая. В открытых базах данных и телефонных справочниках она почти не фиксируется, что говорит либо о малом числе носителей, либо о том, что фамилия бытует в основном в сельской местности и не попала в цифровые реестры. Это не фамилия дворянского или купеческого рода — скорее всего, она принадлежит потомкам крестьян или мещан, которые получили её при переписях населения в XIX — начале XX века.