Фамилия Мукбилшоев — редкий пример фамилии, образованной от арабского имени через таджикское посредничество. В основе лежит арабское имя «Мукбил» (مقبل), которое означает «обращающийся», «принимающий», «благосклонный» или «идущий навстречу». В мусульманской традиции это имя часто давали с пожеланием, чтобы человек был обращён к добру и пользовался расположением. Вторая часть — «шоев» — указывает на происхождение от отца. У таджиков и некоторых народов Центральной Азии суффикс -ев или -ов прибавляется к именам, образуя фамилии по русской модели: Мукбилшоев буквально означает «сын Мукбилшо».

Разбор на составные части даёт ключ к пониманию. Имя «Мукбилшо» сложное: «Мукбил» + «шо» (персидское «шах» — царь, владыка). В дореволюционной Средней Азии такие составные имена (например, Абдулло, Назаршо) были распространены среди знати и зажиточных слоёв, но не только — их могли давать и простым людям в честь уважаемых предков. Таким образом, Мукбилшоев — это «потомок того, кто подобен благосклонному царю» или «сын того, кого зовут Мукбилшо».

Географически фамилия почти полностью привязана к Таджикистану, особенно к Горно-Бадахшанской автономной области. Это характерный признак памирских фамилий, где сохранились древние иранские корни и арабские заимствования. Встречается она и среди таджикской диаспоры в России, но за пределами Средней Азии — исключительная редкость. В отличие от массовых русских фамилий на -ов, которые в XIX веке получили крестьяне, Мукбилшоев — фамилия, возникшая в советское время, когда у народов Средней Азии начали массово оформлять паспорта с фамилиями по отчеству.

С точки зрения словообразования интересен суффикс -ев, а не -ов. Он появляется, когда основа имени заканчивается на мягкий согласный или на «ш». «Мукбилшо» в русской передаче даёт «Мукбилш» (конечный гласный отбрасывается), и к этой основе добавляется -ев. Такая модель типична для фамилий из тюркских и иранских языков, адаптированных русской канцелярией.

Если сравнивать с однокоренными, то существует фамилия Мукбилов — без части «шо». Появление варианта с «шо» могло указывать на более высокое социальное положение предка или на желание подчеркнуть уважение к нему при записи. В любом случае, Мукбилшоев — не случайный набор звуков, а точная генеалогическая метка, ведущая к конкретному человеку по имени Мукбилшо, жившему, скорее всего, на Памире в конце XIX — начале XX века.