Фамилия Мухсабекян — армянская по происхождению, что сразу выдают суффиксы и основа. В армянской ономастике фамилии на -ян (реже -янц) составляют подавляющее большинство: они указывают на принадлежность к роду, буквально «из дома такого-то» или «потомок такого-то». Мухсабекян — не исключение.

В основе фамилии лежит личное имя Мухсабек. Оно составное, и здесь кроется главная особенность. Первая часть — Мухс- — восходит к арабскому корню, связанному с понятием «чистый», «искренний» (в армянском языке это слово могло закрепиться через мусульманское влияние, особенно в регионах, где армяне жили бок о бок с тюркскими и персидскими народами). Вторая часть — -бек — тюркский титул, означающий «господин», «князь», «предводитель». В армянской среде такие имена, как Абдулбек, Асланбек или Мухсабек, встречались в семьях, которые исторически находились под культурным или политическим влиянием соседних тюркских государств (Османской империи, Персии). Имя Мухсабек, таким образом, можно перевести как «чистый господин» или «искренний князь» — прозвище, которое давали человеку за его нрав или положение.

Фамилия Мухсабекян образована по стандартной армянской модели: к основе Мухсабек- прибавлен патронимический суффикс -ян (вариант — -янц). Это значит, что первого носителя фамилии звали Мухсабеком, а его дети и внуки стали Мухсабекянами — «из рода Мухсабека».

Географически фамилия распространена среди армян, чьи предки жили в Западной Армении (исторические области, ныне на востоке Турции) или в регионах с сильным тюркским влиянием. Встречается она и у армянской диаспоры, особенно в России, США, Франции. Сословно носители фамилии могли быть как мелкими землевладельцами, так и ремесленниками или торговцами — титул «бек» в имени не обязательно означал реальное княжеское достоинство, часто его давали как уважительное прозвище.

В написании фамилии стоит обратить внимание на букву х в корне. В русском языке она пишется именно так, хотя в армянском оригинале может быть разное произношение (твердое или мягкое «х»). Сравните с однокоренными фамилиями: Мухсаян, Мухсатов — все они указывают на то же имя, но с разными суффиксами. Мухсабекян — одна из немногих, сохранивших полную форму с титулом «бек», что делает её более узнаваемой и исторически насыщенной.