Фамилия Мухьянов — редкий пример, где корень неочевиден, а суффикс указывает на восточное происхождение. Формально это типичная русская патронимическая модель на -ов, но основа Мухьян (а не Мухан или Мухин) выдаёт тюркский или арабо-персидский след. Скорее всего, фамилия образована от личного имени Мухьян — варианта арабского имени Мухсин (в значении «благодетель», «творящий добро»). В тюркских языках, особенно у татар и башкир, звук «с» часто переходит в мягкое «х» или «хъ», поэтому Мухсин превратился в Мухьян. Другая версия — связь с арабским именем Мухий (дающий жизнь, оживляющий), но форма Мухьян более характерна для татарской ономастики.

Суффикс -ов в фамилии Мухьянов — не случайность. Он прикрепился на русской почве, когда носители имени Мухьян попали в среду русского делопроизводства. В XVI–XVII веках так оформляли фамилии служилым татарам, башкирам и другим выходцам из Поволжья. Поэтому географически фамилия чаще всего встречается в Татарстане, Башкортостане, Оренбургской и Челябинской областях. Встречаются варианты написания Мухянов (с одной «ь»), что объясняется упрощением при записи в паспортах.

Примечательно, что фамилия Мухьянов не имеет ничего общего с русскими фамилиями от слова «муха» (Мухин, Муханов). Корень здесь иной, и попытка возвести её к прозвищу Муха или Мухан была бы ошибочной. Если проследить социальный контекст, предки носителей фамилии — скорее всего, крестьяне или мелкие служилые люди из тюркоязычных групп, принявших православие или сохранявших ислам, но при этом попавших в русскую систему фамильных имён. В любом случае, фамилия Мухьянов — это не про насекомых, а про старый восточный корень, который переосмыслили в русском окончании.