Фамилия Мункожаргалов — редкий пример, когда в основе лежит не прозвище, не ремесло, а полное имя, причём составное и нехристианское. Она происходит от бурятского мужского имени Мункэжаргал (встречаются варианты написания Мункэ-Жаргал, Мункожаргал). Переводится это имя как «вечное счастье» или «вечная благодать»: «мүнхэ» — вечный, «жаргал» — счастье, блаженство. Такие имена-пожелания были распространены у бурят, особенно у родов, исповедующих буддизм: родители давали ребёнку имя, которое должно было привлечь к нему удачу и благополучие на всю жизнь.

Фамилия образована по стандартной русской модели: к основе Мункожаргал прибавлен патронимический суффикс -ов. Это типичный случай, когда бурятское имя русифицировали при переходе на фамилии в XIX — начале XX века. Местные писаря или священники, записывая бурят в метрики, просто добавляли «-ов» к отцовскому имени, превращая его в фамилию сына. Таким образом, Мункожаргалов буквально означает «сын (или потомок) человека по имени Мункожаргал».

Географически фамилия почти наверняка привязана к Бурятии, Забайкальскому краю или Иркутской области — к территориям, где традиционно жили буряты. Сословно предки Мункожаргаловых, скорее всего, относились к бурятским казакам или крестьянам. В бурятских родах не было крепостного права, поэтому многие фамилии такого типа не несут следов дворянского или купеческого происхождения — они просто фиксируют родовое имя.

Стоит отметить, что конечная часть фамилии — «-галов» — иногда вводит в заблуждение. Похожие окончания встречаются в русских фамилиях от прозвищ (например, Галкин), но здесь это часть бурятского имени, а не отдельный корень. В самой Бурятии встречаются фамилии Мункожаргалов и Мункэжаргалов, разница только в передаче гласной. Носителей фамилии немного, она редкая даже для региона, что делает её ярким маркером конкретной семейной линии.