Фамилия Мурушкина образована от ласкового именования Мурушка — одной из многих уменьшительных форм женского имени Мария. В старину так могли звать девушку или женщину в кругу семьи, и это имя-прозвище переходило к её детям и внукам: сначала как отчество, а затем и как закрепившаяся фамилия. Рядом с Мурушкой в этом ряду стоят Маша, Маруся, Маня, Мура, Мурка, Мурочка, Марьюшка, Марьяша — все они восходят к одному библейскому имени.

Мария — имя Богоматери, поэтому оно получило широчайшее распространение у христианских народов. В православной традиции, однако, крестили обычно не в честь Девы Марии, а в честь других святых с этим именем — например, Марии Египетской или Марии Магдалины. Это не мешало имени оставаться одним из самых частых: отсюда и такое разнообразие домашних форм, каждая из которых могла дать начало отдельной фамилии.

Сам суффикс -ин в фамилии Мурушкина указывает на принадлежность: Мурушкин буквально значит «сын (или дочь) Мурушки». Такая модель типична для русских фамилий, образованных от женских имён и прозвищ, — она встречается реже, чем патронимы на -ов/-ев, но вполне обычна для имён, которые бытовали в женской среде.

Фамилия Мурушкины фиксируется в документах. В Книге памяти Рязанской области упоминается крестьянин Мурушкин Константин Андреевич, родившийся в 1887 году в селе Темирево Пителинского района. Эта запись — редкая конкретная зацепка: она связывает род с рязанской землёй и показывает, что в конце XIX века Мурушкины были крестьянским родом, жившим в центральной России.

Процесс формирования фамилий растянулся на столетия, и точно сказать, когда и где именно возник род Мурушкиных, без генеалогических изысканий нельзя. Но само имя-основа говорит о тёплом, домашнем происхождении: предки носителей фамилии звали свою мать или бабушку не иначе как Мурушка.