Фамилия Мусерская — редкий случай, когда географическое название почти наверняка перешло в фамилию без посредничества прозвища или профессии. Основа здесь — топоним Мусеры. Сразу несколько населённых пунктов с таким именем существовали на территории бывшей Российской империи: например, деревня Мусеры в бывшей Витебской губернии (ныне Беларусь) или хутор с тем же названием на Кубани. Фамилию мог получить либо выходец из такого места, либо, что вероятнее для формы на -ская, дворянин, которому принадлежало имение Мусеры.

Типичная модель образования для фамилий польского и западнорусского дворянства: владелец поместья записывался по его названию с суффиксом -ский/-цкий. Так Мусерский (а женская форма — Мусерская) обозначал «тот, кто из Мусер». В польской ономастике эта модель была особенно распространена среди шляхты, поэтому не исключено, что предок носителя фамилии был мелкопоместным дворянином из-под Витебска или Минска.

Второй, менее вероятный вариант — происхождение от прозвища Мусер. В русских говорах слово «мусер» могло означать «мусорщик» (от немецкого «Müller»? — но это спорно) или «человек, роющийся в отбросах». Однако суффикс -ская плохо сочетается с таким прозвищем: крестьянину или ремесленнику дали бы фамилию Мусеров или Мусерин. Форма на -ская твёрдо указывает либо на географическую, либо на помещичью природу.

По сословному составу носителей фамилии в XIX веке данных мало. В метрических книгах Санкт-Петербургской губернии встречаются отдельные записи о Мусерских — мещанах и купцах, что косвенно подтверждает городское или шляхетское происхождение, поскольку крестьяне почти не носили фамилий на -ский.

Сегодня фамилия Мусерская остаётся крайне редкой. Её можно встретить в России, Беларуси и среди эмигрантов первой волны. Из-за малочисленности носителей составить портрет типичного предка сложно, но с высокой долей уверенности можно сказать: корни фамилии — в географическом названии, а не в ремесле или личной черте.