Фамилия Мыночка — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. Первое, что бросается в глаза, — суффикс -к(а), который в русских фамилиях встречается нечасто. Обычно он характерен для украинской и белорусской традиции, где уменьшительные формы имён и прозвищ легко становились фамилиями. Если бы фамилия была русской, она скорее звучала бы как Мынов или Мынин. Поэтому географически её стоит искать на юго-западе исторической России — в Малороссии, на Слобожанщине или в Беларуси.

С корнем сложнее. В русских говорах слово «мынок» не зафиксировано, но в украинском языке есть «мин» (монета) и «мина» (выражение лица). Однако фамилия пишется через ы, а не через и, что сближает её со словом «мыть». Возможно, основа — мын- — это диалектный вариант глагола «мыть» или существительного «мыло». В таком случае Мыночка — это прозвище человека, связанного с мытьём: прачки, банщика, мыловара. Уменьшительная форма («мойщик» → «мынок» → «Мыночка») могла закрепиться за ребёнком такого ремесленника или за самим человеком небольшого роста или мягкого нрава.

Есть и другая версия, менее очевидная, но правдоподобная для южных регионов. В польском языке есть слово mynka — «мучная пыль» или «мельница». Через польское влияние на украинские говоры это могло перейти в прозвище работника мельницы. Тогда Мыночка — это «мельничонок», помощник мельника. Фамилии с суффиксом -к(а) часто давали по занятию отца: кузнец — Кузнечка, мельник — Мельничка, а здесь — Мыночка.

Сравнение с однокоренными фамилиями помогает уточнить ареал. Фамилии Мынов, Мынин, Мынь встречаются в основном в Черниговской и Полтавской губерниях, а также в Беларуси. Мыночка — их уменьшительный вариант, который мог закрепиться в одной семье и не получить распространения. В дореволюционных метрических книгах эта фамилия почти не встречается, что говорит о её крайней редкости и локальности.

Сословная принадлежность предков, скорее всего, крестьянская или мещанская. Фамилии на -к(а) редко носили дворяне, а в среде духовенства они тоже нехарактерны. Мыночка — это фамилия человека из простонародья, чьё прозвище дали по делу или по внешности, и оно не ушло дальше одного села или хутора.